上海到昆明的宠物托运方式：

航空运输：如果您的出发地点和目的地有航班，并且是有氧舱的话，空运是比较快捷的方式。不过费用较高，还需要到机场所在地的“畜牧局”或者“动检所”开“检疫证明”，如果没有“检疫证明”，机场是拒绝上飞机的。

汽运：如果您需要从上海到北京的长途旅行，可以选择汽运。这种方式相对便宜，但是需要提前与托运公司联系，并确保您的宠物安全送达目的地。

大巴托运：如果您选择乘坐大巴前往北京，也可以将宠物托运在大巴上。但是需要注意的是，大巴托运的限制较多，需要提前了解相关规定。

无论您选择哪种方式，都需要确保宠物的安全和健康。建议选择有信誉的托运公司或者专业的宠物托运服务，避免出现意外情况。同时，在托运前，需要了解目的地的相关法规和规定，确保您的宠物符合要求。